همسر شهید علی‌محمدی دانشمند هسته‌ای ترور شده جزئیاتی از تلاش سازمان مجاهدین خلق (منافقین) برای جمع‌آوری اطلاعات از همسرش را فاش کرد.
وی اظهار داشت که شخصاً شاهد تلاش منافقین برای تخلیه اطلاعاتی بوده است. همسر شهید علی‌محمدی توضیح داد که حدود ده روز قبل از شهادت شهید علی‌محمدی ایمیلی را به وی نشان داد که در آن منافقین تصاویری از برخی سایت‌های هسته‌ای را ارسال کرده و از او خواسته بودند تا نظر و اطلاعات خود را در این زمینه ارائه دهد.
شهید علی‌محمدی به همسرش گفته بود که این موضوع را به مسئولان حراستی مربوطه اطلاع خواهد داد. همسر شهید تاکید کرد که منافقین ده روز پس از این ماجرا و به دلیل عدم همکاری شهید علی‌محمدی او را به شهادت رساندند.
همسر شهید علی‌محمدی همچنین گفت که در زمان حیات همسرش منافقین با وی نیز تماس گرفته و خود را از دفتر دکتر رهبر رئیس دانشگاه معرفی کرده بودند. آنها با این ادعا که دکتر رهبر با شهید علی‌محمدی کار فوری دارد و موفق به یافتن او نشده‌اند شماره تماس وی را درخواست کردند. همسر شهید که از ماهیت این افراد اطلاعی نداشت شماره همسرش را در اختیار آنان قرار داد.
عصر همان روز شهید علی‌محمدی به منزل بازگشت و همسرش ماجرا را برای او تعریف کرد و گفت که دکتر رهبر با وی تماس گرفته و کار فوری داشته است. شهید علی‌محمدی در پاسخ گفت که منافقین با او تماس گرفته و قصد تخلیه اطلاعاتی داشته‌اند که وی متوجه شده و تماس را قطع کرده است.