در سال ۱۳۲۳ خشکسالی طولانی‌مدت زندگی مردم قم را تحت تاثیر قرار داده بود. پس از ناامیدی از بارش باران اهالی قم به نزد سه تن از مراجع تقلید آن زمان رفته و خواستار برگزاری نماز باران شدند.
آیتالله خوانساری به مردم توصیه کرد سه روز روزه بگیرند و در روز سوم که مصادف با جمعه بود برای اقامه نماز استسقاء در مصلی حاضر شوند.
حدود ۲۰ هزار نفر از مردم قم که معادل دو سوم جمعیت شهر بود در مصلی حاضر شده و نماز خواندند اما باران نبارید. نیروهای متفقین که در حاشیه قم مستقر بودند با تمسخر به آیتالله گفتند عبای خود را جمع کند تا خیس نشود.
آیتالله در روز بعد نیز نماز را اقامه کرد و این بار ورق برگشت. بارش شدیدی آغاز شد به گونه‌ای که رودخانه خشک شده که اکنون به پارکینگ تبدیل شده بود تا لبه خیابان پر از آب شد. نیروهای متفقین با دیدن این صحنه شگفت‌زده شده و با تعجب گفتند که آیا مسیح ظهور کرده است.
آیتالله مجتهدی معتقد بود که این باران به دلیل دعای مردی با کلاه نمدی بوده که در روز دوم در نماز حضور داشته است.