پس از گذشت دو روز از حادثه انفجار در بندر شهید رجایی و در حالی که هنوز علت دقیق این رویداد مشخص نشده است گمانه‌زنی‌ها در فضای مجازی و شبکه‌های غیررسمی خبری افزایش یافته است.
برخی منابع غیررسمی از احتمال انفجار محموله سوخت موشک در این بندر خبر داده‌اند.
با این حال آگاهان به مسائل گمرکی و حمل‌ونقل نظامی معتقدند که محموله‌های نظامی در صورت وجود مستقیماً به مقاصد نظامی منتقل می‌شوند و فرآیندهای معمول گمرکی را طی نمی‌کنند.
بنابراین احتمال انفجار سوخت موشک در محدوده گمرک بندر شهید رجایی ضعیف به نظر می‌رسد.